70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0832 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  98.56 
 
 		 170 aa  284  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.22 
 
 		 137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  62.96 
 
 		 137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.74 
 
 		 137 aa  176  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.82 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.06 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.69 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  57.03 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  56.49 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  48.09 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  48.46 
 
 		 131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  48.46 
 
 		 131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  49.26 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  44.8 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  42.4 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.33 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.61 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 138 aa  95.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  43.81 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  37.82 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.29 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.97 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.83 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  36.52 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.18 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  38.14 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  37.11 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  37.62 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.62 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  37.62 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  33.09 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  38.14 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  36.19 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.96 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.96 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  36.46 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.93 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.38 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  33.66 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2140  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 288 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  44.62 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  30.1 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  35.48 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  32.56 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  28.72 
 
 		 122 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 171 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  36.49 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  31.94 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.04 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  32.26 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  31.76 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  30.88 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 165 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>