21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2078 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  319  9.000000000000001e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0147  hypothetical protein  37.67 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  38.02 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.61 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.91 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  33.97 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  30 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  34.68 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  36.13 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  35.04 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  36.75 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  35.9 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  34.19 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  30.67 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  32.48 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  27.97 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 784 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05330  hypothetical protein  28.95 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>