22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3382 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  100 
 
 		 163 aa  329  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  96.32 
 
 		 163 aa  278  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  70.44 
 
 		 162 aa  229  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  74.26 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  46.58 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  46 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  44.97 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.95 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  42.48 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  43.67 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  39.19 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  42.97 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  38.36 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  37.69 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  41.44 
 
 		 142 aa  91.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0147  hypothetical protein  42.2 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  33.55 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  32.48 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2659  hypothetical protein  29.49 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  31.43 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05330  hypothetical protein  30.1 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>