34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3446 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 157 aa  322  9e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  54.61 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  43.79 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  49.64 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  42.68 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  47.69 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  43.7 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  47.69 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  42.45 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  44.2 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  45.11 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.95 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  38.35 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  38.06 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  36.43 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0147  hypothetical protein  37.96 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  37.61 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05330  hypothetical protein  32.38 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  30.41 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  29.31 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0113  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.83 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.992121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1441  hypothetical protein  28.78 
 
 		 283 aa  48.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  28.8 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2659  hypothetical protein  32.31 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10183  hypothetical protein  26.96 
 
 		 279 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3954  cupin 2 domain-containing protein  35.8 
 
 		 105 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.07 
 
 		 221 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  25.38 
 
 		 140 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  26.92 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.81 
 
 		 222 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.07 
 
 		 221 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.07 
 
 		 221 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>