16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2659 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2659  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  63.31 
 
 		 159 aa  183  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  58.67 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  36.36 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  29.49 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  33.9 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  26.11 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  32.67 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  39.34 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2639  hypothetical protein  33.01 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.31 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  28.36 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.91 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>