19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1816 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  100 
 
 		 158 aa  327  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  55.06 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2659  hypothetical protein  58.67 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  33.05 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  30.43 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  33.04 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.31 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  33.33 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  30.53 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  38.1 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  31.53 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  28.57 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3285  hypothetical protein  28.79 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  27.19 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  32.93 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  34.29 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2639  hypothetical protein  28.57 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>