51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2801 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  44.76 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  38.62 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  36.5 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  32.82 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  31.3 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  31.3 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.3 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  31.3 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.3 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.3 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  31.3 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  29.29 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  29.55 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  28.83 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  28.83 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  29.8 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  29.8 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  30.53 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  32.54 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.2 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  30.4 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  30.95 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  30.4 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  31.34 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  30.83 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  29.85 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  27.46 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  30.71 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  28.8 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  28.8 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  28.8 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  28.8 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  28.8 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2232  anti-sigm factor, ChrR  28.36 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  28.8 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  28.28 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  30.08 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  27.54 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1715  anti-ECFsigma factor, ChrR  30 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1642  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.09 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.042351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  28.57 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3285  hypothetical protein  35.53 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0811  hypothetical protein  25.45 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3966  acetylacetone-cleaving enzyme  25.5 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.382041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3659  acetylacetone-cleaving enzyme  28.03 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>