47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5302 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  96.05 
 
 
177 aa  362  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  96.05 
 
 
177 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  94.92 
 
 
177 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  94.92 
 
 
177 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  94.92 
 
 
177 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  93.79 
 
 
177 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  77.97 
 
 
177 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  74.58 
 
 
177 aa  291  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  73.45 
 
 
177 aa  289  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  73.45 
 
 
177 aa  288  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  73.45 
 
 
177 aa  288  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  65.34 
 
 
176 aa  253  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  59.32 
 
 
177 aa  236  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  42.94 
 
 
187 aa  144  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  42.33 
 
 
175 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  40.11 
 
 
177 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  42.33 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  40 
 
 
175 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  39.26 
 
 
185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  39.35 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 
157 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  34.97 
 
 
162 aa  89  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  32.21 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.82 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  32.54 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  29.2 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  29.23 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  28.8 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  33.33 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
163 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  29.82 
 
 
164 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  29.82 
 
 
160 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  29.82 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  29.82 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  29.82 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  29.82 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  29.82 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  28.95 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.61 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  29.59 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  29.59 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  25.98 
 
 
168 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0241378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>