47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0304 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  351  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  91.67 
 
 		 168 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  91.67 
 
 		 168 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  84.34 
 
 		 170 aa  298  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4571  hypothetical protein  51.57 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2131  hypothetical protein  52.38 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0861982  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  34.55 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  30.34 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  37.61 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  34.55 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  34.55 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  34.55 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  34.55 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  34.55 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  36.89 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  34.55 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  37.61 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  37.61 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  38.1 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  32.59 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  36.7 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  37.18 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  36.7 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  36.7 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  37.21 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  28.72 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  28.21 
 
 		 176 aa  51.2  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  30.11 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  32.35 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  26.77 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  26.77 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  27.56 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  26.77 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  25.98 
 
 		 177 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  27.93 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.31 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  32 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  30.28 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>