56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4201 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  331  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  99.39 
 
 		 163 aa  329  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  95.71 
 
 		 163 aa  317  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  95.09 
 
 		 163 aa  315  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  95.09 
 
 		 163 aa  315  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  93.87 
 
 		 163 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  88.34 
 
 		 168 aa  296  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  73.83 
 
 		 164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  73.83 
 
 		 164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  73.83 
 
 		 164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  73.83 
 
 		 164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  73.83 
 
 		 164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  73.83 
 
 		 160 aa  223  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  73.15 
 
 		 164 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  71.81 
 
 		 164 aa  220  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  44.59 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  40.14 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  34.69 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  33.9 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  35.56 
 
 		 187 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  29.14 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  28.83 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  31.37 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  31.54 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  31.76 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  37.74 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  30 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.13 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2232  anti-sigm factor, ChrR  35.83 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  36.56 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  30.28 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  36.79 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  36.79 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  37.61 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  35.79 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  34.41 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  33.75 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  32.26 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  27.69 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1715  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1642  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.042351  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0264  hypothetical protein  30.77 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2131  hypothetical protein  44.07 
 
 		 101 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0861982  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4571  hypothetical protein  46 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0768  hypothetical protein  31.09 
 
 		 159 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0811  hypothetical protein  33.77 
 
 		 134 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>