48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1871 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  61.24 
 
 		 178 aa  230  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  38.24 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  37.59 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  38.17 
 
 		 177 aa  88.2  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  36.64 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  34.09 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  32.89 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  36.13 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  36.61 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  32.21 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  33.33 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  35.29 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  35.29 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  34.35 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  33.59 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  34.35 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  30.2 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  29.29 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  33.6 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  35.19 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  31.78 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  33.04 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  28.47 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  29.82 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  26.47 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  31.19 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  31.19 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  30.28 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  28.83 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  24.63 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  31.76 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  32.93 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  32.93 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  32.93 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  32.93 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  32.93 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  36.47 
 
 		 170 aa  47.8  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2598  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.13 
 
 		 243 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2637  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.13 
 
 		 240 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1748  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.68 
 
 		 243 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0800571  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2712  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.68 
 
 		 243 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>