49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0381 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  334  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  53.8 
 
 		 156 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  44.76 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  42.65 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  42.96 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  42.96 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  41.5 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  42.96 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  40.82 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  40.74 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  40.14 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  40 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  40 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  40 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  40 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  40 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  40 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  39.26 
 
 		 164 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  40.69 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  34.13 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  34.13 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  32.54 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  32.54 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  31.78 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  31.75 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  32.48 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.16 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  26.87 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  29.37 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  29.77 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  26.98 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  29.46 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  29.37 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  24.63 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  28.39 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  33 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  32.77 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  32.77 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  27.13 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  32.99 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0264  hypothetical protein  27.08 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4571  hypothetical protein  35.48 
 
 		 168 aa  43.9  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>