48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3146 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  96.61 
 
 
177 aa  361  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  96.61 
 
 
177 aa  361  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  96.61 
 
 
177 aa  361  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  95.48 
 
 
177 aa  356  7e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  94.92 
 
 
177 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  93.79 
 
 
177 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  77.97 
 
 
177 aa  299  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  74.58 
 
 
177 aa  292  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  74.01 
 
 
177 aa  291  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  74.58 
 
 
177 aa  290  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  74.58 
 
 
177 aa  290  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  65.34 
 
 
176 aa  255  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  57.06 
 
 
177 aa  231  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  42.94 
 
 
175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  42.35 
 
 
187 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  42.86 
 
 
175 aa  140  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  39.55 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  41.1 
 
 
185 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  41.1 
 
 
175 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  41.29 
 
 
187 aa  120  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  38.03 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  34.06 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  32.17 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  35.29 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  31.75 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  28.81 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  33.63 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  32.74 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  28.8 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
163 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  33.33 
 
 
163 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.86 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  31.86 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  31.86 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.86 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  31.86 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  31.86 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.63 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  26.77 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  26.77 
 
 
168 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  26.77 
 
 
168 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1715  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.26 
 
 
143 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>