49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0538 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  100 
 
 		 162 aa  330  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  43.45 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  46.21 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  41.38 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  43.61 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  43.75 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  41.61 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  40.69 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  38.78 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  38.24 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  35.66 
 
 		 177 aa  96.3  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  38.82 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  34.97 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  34.97 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  39.84 
 
 		 176 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  34.97 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  36.36 
 
 		 177 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  36.5 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  33.57 
 
 		 177 aa  87.4  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  34.27 
 
 		 177 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  34.27 
 
 		 177 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  34.27 
 
 		 177 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  36.23 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  36.23 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 177 aa  84.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  32.17 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  36.59 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  36.44 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  39.25 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  39.25 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  39.25 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  39.25 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  39.25 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  33.08 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  39.25 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  33.08 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  33.08 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  34.75 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  38.32 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  37.11 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  33.67 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  33.67 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  32.35 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1715  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.24 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1642  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.24 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.042351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>