49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3051 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  100 
 
 		 177 aa  370  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  80.79 
 
 		 177 aa  314  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  80.79 
 
 		 177 aa  313  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  79.1 
 
 		 177 aa  307  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  79.1 
 
 		 177 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  77.97 
 
 		 177 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  77.4 
 
 		 177 aa  300  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  77.97 
 
 		 177 aa  300  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  77.97 
 
 		 177 aa  300  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  77.97 
 
 		 177 aa  300  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  77.97 
 
 		 177 aa  299  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  75.14 
 
 		 177 aa  293  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  64.41 
 
 		 177 aa  256  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  68.21 
 
 		 176 aa  255  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  44.94 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  43.56 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  44.52 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  43.29 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  44.74 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  42.86 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  39.44 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  36.36 
 
 		 162 aa  87.8  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  32.84 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  33.6 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  31.2 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  30.09 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  30.16 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  31.79 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  31.79 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  31.79 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  38.38 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  31.13 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  38.38 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  31.13 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  37.37 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  37.37 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  37.37 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  37.37 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  37.37 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  37.37 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  30.91 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  33.33 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  31.31 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  31.31 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  31.31 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1715  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.44 
 
 		 143 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1642  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.03 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.042351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>