48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3144 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  98.87 
 
 		 177 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  96.05 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  96.05 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  96.05 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  96.05 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  94.92 
 
 		 177 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  79.1 
 
 		 177 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  74.58 
 
 		 177 aa  292  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  74.58 
 
 		 177 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  72.88 
 
 		 177 aa  288  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  72.88 
 
 		 177 aa  288  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  64.2 
 
 		 176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  57.63 
 
 		 177 aa  235  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  42.44 
 
 		 187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  42.94 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  40.68 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  42.68 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  41.82 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  39.88 
 
 		 185 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  40.65 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  38.73 
 
 		 157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  34.97 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  36.13 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  32.58 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  32.54 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  28.81 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  34.41 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  34.41 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  34.41 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  34.41 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  27.56 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.7 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.7 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  30.7 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  30.7 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.7 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  30.7 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  30.7 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  27.56 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  29.82 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  27.93 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  27.93 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  26.77 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1715  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.89 
 
 		 143 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>