61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3343 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  100 
 
 		 175 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  75.43 
 
 		 175 aa  288  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  75.57 
 
 		 185 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  73.14 
 
 		 175 aa  277  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  72.94 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  62.29 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  55.43 
 
 		 187 aa  209  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  65.25 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  43.03 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  41.82 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  41.82 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  40.91 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  42.86 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  42.86 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  41.1 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 177 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  37.42 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  40.26 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  40.26 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  38.96 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  41.61 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  32.37 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  30.72 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  31.65 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  33.04 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  30.94 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  41.56 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  31.06 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  31.78 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  31.78 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  30.08 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  30.08 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.08 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  30.08 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.08 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.08 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.36 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  30.08 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  28.66 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  28.28 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  27.13 
 
 		 158 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1715  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.2 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1642  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.2 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.042351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.81 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3481  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.81 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.81 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.13 
 
 		 221 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0811  hypothetical protein  30.21 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1495  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.53 
 
 		 222 aa  44.3  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2232  anti-sigm factor, ChrR  28.32 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0768  hypothetical protein  35.79 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 114 aa  41.6  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 114 aa  41.6  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000607  hypothetical protein  28.16 
 
 		 223 aa  41.6  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2131  hypothetical protein  46.34 
 
 		 101 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0861982  normal  0.884924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>