57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0499 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  99.38 
 
 
164 aa  323  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  99.38 
 
 
164 aa  323  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  99.38 
 
 
164 aa  323  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  99.38 
 
 
164 aa  323  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  99.38 
 
 
164 aa  323  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  98.75 
 
 
164 aa  322  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  95.3 
 
 
164 aa  295  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  76.32 
 
 
168 aa  239  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  73.12 
 
 
163 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  73.12 
 
 
163 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  73.12 
 
 
163 aa  233  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  71.43 
 
 
163 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  74.34 
 
 
163 aa  229  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  74.34 
 
 
163 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  46.21 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  42.17 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  39.25 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  33.12 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  31.21 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  29.45 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  30.07 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  38.94 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  30.5 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  35.85 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  31.34 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  32.17 
 
 
177 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2232  anti-sigm factor, ChrR  33.61 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  31.2 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  31.2 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  31.2 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  30.4 
 
 
177 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  30.4 
 
 
177 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  26.28 
 
 
187 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.43 
 
 
178 aa  57.4  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  29.6 
 
 
177 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  35.92 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  31.86 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  35.92 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  34.55 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  39.02 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  39.02 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  32.93 
 
 
177 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.08 
 
 
177 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  33.33 
 
 
177 aa  53.9  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1642  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.37 
 
 
143 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.042351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1715  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.37 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  37.8 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3894  cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4571  hypothetical protein  37.65 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0768  hypothetical protein  30.3 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7184  hypothetical protein  34.67 
 
 
114 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00083375  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  36.92 
 
 
145 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6449  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.25 
 
 
117 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0335897 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0264  hypothetical protein  26.47 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>