22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0264 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0264  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  344  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0811  hypothetical protein  30.84 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  32.65 
 
 		 132 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  26.62 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  27.08 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  27.7 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  27.7 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  27.7 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4571  hypothetical protein  32.89 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  38.36 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  26.47 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  26.47 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  26.47 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  26.47 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  26.47 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  29.67 
 
 		 160 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  29.67 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  29.67 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4247  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.98 
 
 		 236 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>