26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4571 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4571  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  353  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  49.69 
 
 		 170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  53.52 
 
 		 168 aa  158  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  52.82 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  52.82 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2131  hypothetical protein  56.16 
 
 		 101 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0861982  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  46 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  46 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  31.67 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  31.67 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  31.67 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.67 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.67 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  32.56 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  31.67 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.67 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  35.48 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  33.33 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  31.58 
 
 		 132 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  42 
 
 		 163 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  32.93 
 
 		 185 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  42 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  42 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0264  hypothetical protein  32.89 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>