14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2131 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2131  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0861982  normal  0.884924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4571  hypothetical protein  56.16 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  50.59 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  51.16 
 
 		 168 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  51.16 
 
 		 168 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  55.07 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  45.76 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  45.76 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  45.76 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  45.76 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  44.07 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  44.07 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  46.34 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>