24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0811 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0811  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  272  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  32.38 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3966  acetylacetone-cleaving enzyme  27.94 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.382041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2876  hypothetical protein  29.84 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3659  acetylacetone-cleaving enzyme  26.61 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0264  hypothetical protein  30.84 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  24.35 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1059  hypothetical protein  27.43 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  30.21 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  28.1 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  27.93 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  27.93 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  22.61 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  21.31 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  27.08 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  27.03 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  32.08 
 
 		 362 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  32.1 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 168 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>