28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2232 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2232  anti-sigm factor, ChrR  100 
 
 
143 aa  285  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1715  anti-ECFsigma factor, ChrR  93.01 
 
 
143 aa  265  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1642  anti-ECFsigma factor, ChrR  91.61 
 
 
143 aa  263  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.042351  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  32.77 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  33.61 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  33.61 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  33.61 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  33.61 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  33.61 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  33.61 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  33.61 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  35.83 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  34.45 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  35.83 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  34.45 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  36.04 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  28.36 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  35.04 
 
 
163 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  34.18 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  35.44 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1553  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.41 
 
 
212 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  28.32 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  26.92 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  28.04 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  28.04 
 
 
187 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.655791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>