40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1715 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1715  anti-ECFsigma factor, ChrR  100 
 
 		 143 aa  286  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1642  anti-ECFsigma factor, ChrR  98.6 
 
 		 143 aa  285  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.042351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2232  anti-sigm factor, ChrR  93.01 
 
 		 143 aa  265  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  34.17 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  33.01 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  33.61 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  33.61 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  33.61 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  34.19 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.11 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.37 
 
 		 164 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.37 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  30.37 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  30.37 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.37 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  30.37 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  30.37 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  35.44 
 
 		 175 aa  50.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  29.2 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  32.91 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  31.78 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  34.26 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  26.24 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  28.04 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  39.44 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  34.26 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  34.26 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  30.89 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  34.26 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  34.26 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  34.26 
 
 		 177 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  27.78 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  36.62 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  35.44 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2958  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>