48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1967 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1967  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.573441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0381  hypothetical protein  53.8 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  47.06 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  44.59 
 
 
163 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0505424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  44.59 
 
 
163 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  44.22 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  43.92 
 
 
163 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  43.92 
 
 
163 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  43.92 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  47.33 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  46.56 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  46.56 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  46.56 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  46.56 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  46.56 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  46.56 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  46.56 
 
 
164 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2801  hypothetical protein  38.62 
 
 
162 aa  120  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0538  cupin 2, barrel  38.78 
 
 
162 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3174  cupin 2 domain-containing protein  34.53 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1695  cupin 2 domain-containing protein  32.48 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2040  cupin 2, barrel  29.86 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2449  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4758  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2715  cupin 2, conserved barrel  31.16 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1870  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  27.61 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0763045  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1869  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30 
 
 
177 aa  67  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0461323  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  35.56 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3343  cupin 2, barrel  31.06 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.235218  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1871  hypothetical protein  28.47 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3152  cupin 2, barrel  31.65 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10920  hypothetical protein  30.97 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286825  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1002  hypothetical protein  30.97 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0167  cupin 2 protein  33.05 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0317478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3051  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  30.09 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2492  cupin 2, barrel  30.08 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103992  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5302  cupin 2 domain-containing protein  29.2 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3144  cupin 2 domain-containing protein  28.81 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5003  cupin 2 domain-containing protein  28.81 
 
 
177 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3146  hypothetical protein  28.81 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1543  cupin 2, barrel  33.93 
 
 
176 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5131  cupin 2, barrel  28.32 
 
 
177 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4495  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 
177 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5728  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 
177 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  35.14 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  35.14 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  36.04 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2232  anti-sigm factor, ChrR  26.92 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>