25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7184 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7184  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  239  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00083375  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1332  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.68 
 
 		 228 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.469882 
 
 
-
 
NC_003296  RS00891  hypothetical protein  26.09 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3840  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.32 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2111  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.7 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6449  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.42 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0335897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.59 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5392  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.71 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0869  anti-sigm factor, ChrR  33.33 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1703  hypothetical protein  35.38 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6445  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.26 
 
 		 244 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0423  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.77 
 
 		 222 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3209  cupin 2 domain-containing protein  36.92 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6152  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.38 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0721  anti-Sigm factor, ChrR  31.86 
 
 		 224 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0339  anti-sigma factor ChrR, putative  31.37 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4481  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.85 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4129  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.11 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0840  anti-sigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 230 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4308  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4058  cupin 2, barrel  35.38 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3725  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0726235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4201  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0505424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>