178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2731 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  47.31 
 
 		 138 aa  93.6  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  40.71 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  39.82 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  38.94 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  47.47 
 
 		 111 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  46.39 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  46.24 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  47.19 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  41.9 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  44.68 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  47.92 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.45 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  31.13 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  41.11 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.8 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  38.95 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  32.69 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.78 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  37.76 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  38.95 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  35.58 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.78 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  31.07 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  34.31 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.58 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.08 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.71 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  36.73 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.8 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.27 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  35.35 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  34 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.35 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.84 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.76 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  32.29 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  32.29 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.54 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.04 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1794  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  33.96 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  38.46 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.08 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.46 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.28 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  29.91 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  27.27 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  39.29 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.19 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  38.81 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0506  hypothetical protein  29.52 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0871689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  50.94 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  49.06 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.57 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  38.2 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  30.93 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  42.59 
 
 		 311 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.74 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.51 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  44.26 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  30.56 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  38.2 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3382  3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase  29.76 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0551388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1221  3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase  38.1 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.512758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  38.46 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.83 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  32.53 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  31.18 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>