79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2408 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 100 aa  201  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  84 
 
 		 100 aa  176  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  84 
 
 		 100 aa  174  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  65.66 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  51.65 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  50.55 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.46 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  47.31 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  43.88 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  48.35 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  43.43 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.4 
 
 		 120 aa  88.6  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  45.65 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.25 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  44.57 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  43.48 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.22 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.86 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.66 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.56 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  40.66 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  34.74 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  38.71 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  38.71 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  38.71 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  37.63 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  37.63 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  35.48 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  39.24 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  34.78 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  29.11 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.37 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2188  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000987781  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  30.14 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  32.58 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  31.96 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  35.44 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.8 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  34.18 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  36.67 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  31.76 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3678  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2183  cupin 2, barrel  35.8 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  30.21 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.06 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.62 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  44.19 
 
 		 158 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  38.3 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.68 
 
 		 255 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  40.62 
 
 		 396 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>