107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2041 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  226  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  60 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.75 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.88 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.94 
 
 		 113 aa  124  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  43.82 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.11 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  39.36 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  36.79 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.86 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  40.43 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.96 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.26 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  33.01 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  38.46 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  37 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  35.79 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.76 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  37.36 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  32.08 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.27 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  31.13 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  36.84 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.36 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  39.53 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.17 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  33.7 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.19 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  32.22 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.07 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  30.48 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.97 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.85 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  31.63 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  31.31 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  32.32 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  32.32 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  32.32 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  31.87 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  27.78 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  36.51 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  27.1 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5217  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3678  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  37.29 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2960  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  20.56 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.14 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.26 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  42 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  44.83 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  47.17 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1794  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.7 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.12 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.21 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.18 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  43.4 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.38 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.62 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4773  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  35.85 
 
 		 113 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.459011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.61 
 
 		 115 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  36.47 
 
 		 235 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.21 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  43.18 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.24 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  33.77 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4501  hypothetical protein  35.85 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 288 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.175935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>