22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3664 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.36 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.33 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.36 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.62 
 
 		 113 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  41.56 
 
 		 122 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.65 
 
 		 107 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.2 
 
 		 113 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  34.12 
 
 		 111 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 107 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  29.09 
 
 		 111 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1794  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  30.59 
 
 		 110 aa  45.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 113 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.37 
 
 		 114 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 		 112 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.44 
 
 		 113 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 107 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 106 aa  41.6  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.37 
 
 		 255 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  36.47 
 
 		 110 aa  41.6  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.52 
 
 		 145 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>