26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1794 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1794  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  225  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1710  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.62 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.743706  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.14 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.96 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.19 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1913  hypothetical protein  30.77 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.425283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0913  cupin 2, barrel  30.77 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  30.59 
 
 		 235 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  30.59 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  32.94 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2268  hypothetical protein  29.11 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 199 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.24 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7093  hypothetical protein  38.78 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  29.31 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 182 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>