123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0865 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  223  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  74.75 
 
 		 100 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  65.35 
 
 		 102 aa  156  9e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  47.57 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  39.81 
 
 		 116 aa  93.6  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.24 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  39.36 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  36.79 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  36.79 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  36.79 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  35.35 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.34 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  33.64 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.63 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.73 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  32.04 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  39.29 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  39.02 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  30.21 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.04 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.91 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.65 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.61 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  27.45 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.94 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  26.26 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  52.94 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  27.08 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  34.62 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.79 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  32.05 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  28.87 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.49 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.28 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  36.92 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.94 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5823  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410893  normal  0.322015 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  47.06 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  29.85 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.02 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  47.06 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1710  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 94 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 		 110 aa  47.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  28 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  28.57 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  27.91 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  28.85 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  33.73 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3731  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  36.78 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 292 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 271 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6850  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3608  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 271 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0804414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3485  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 271 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3410  transcriptional regulator, AraC family  31.94 
 
 		 272 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.623928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  41.18 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  27.37 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 285 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1794  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  30.59 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  35.94 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  33.33 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.47 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.33 
 
 		 122 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0113  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 119 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  25.77 
 
 		 334 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0025  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1050  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 314 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.53 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>