115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4592 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  74.77 
 
 		 113 aa  157  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.64 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.61 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.91 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.8 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.79 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  36.63 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  31 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  35.62 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  30.93 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  30.93 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  32.53 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  28.44 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  34.62 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 292 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  28.12 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5217  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  33.68 
 
 		 269 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 202 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  26.74 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4773  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  33.85 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.459011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 273 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2960  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  33.71 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  36 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  31.15 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  31.15 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  33.73 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.91 
 
 		 121 aa  42  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.34 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 		 343 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  36.62 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  32.63 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2766  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.21 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 199 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 170 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.95 
 
 		 121 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 170 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4501  hypothetical protein  32.81 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.59 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  38.81 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 211 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 211 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>