21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2766 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2766  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 115 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4501  hypothetical protein  71.43 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4773  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  68.75 
 
 		 113 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.459011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5217  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.06 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.49 
 
 		 182 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2960  cupin 2 domain-containing protein  54.05 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3678  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.55 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  55.67 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  41.07 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  46.67 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  46.67 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  46.67 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  44.44 
 
 		 278 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  30.65 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  44.44 
 
 		 278 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>