22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2960 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2960  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5217  Cupin 2 conserved barrel domain protein  77.48 
 
 		 112 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2766  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.05 
 
 		 115 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4773  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  53.15 
 
 		 113 aa  134  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.459011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4501  hypothetical protein  54.05 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3678  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.07 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.88 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  60.61 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  40.68 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.62 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.37 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.81 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.18498 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  35.42 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 100 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.34 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 234 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>