121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3553 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  79.09 
 
 		 111 aa  176  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.53 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  47.42 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.56 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  40.95 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.58 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.47 
 
 		 113 aa  84.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  35.79 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.18 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  37.89 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  34.74 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  37.89 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  36.63 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  35.87 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  35.87 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  36.08 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.22 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  42.5 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.58 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.38 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  32.99 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  35.79 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  35.35 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  35.35 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.16 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.37 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  43.75 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  34.69 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  34.74 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.37 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  35.65 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  46.38 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  35.65 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  36.52 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  32.04 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.37 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  29.67 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.79 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.53 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.42 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  33 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  31.43 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  27.03 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  26.51 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  34.12 
 
 		 235 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  29.87 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  34.25 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  25.64 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.03 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  34.67 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  34.25 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3678  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  36.51 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  32.67 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  29.76 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.21 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  26.03 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  25.86 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 277 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.4 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  31.08 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  30.51 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>