65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2960 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 110 aa  224  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  69.09 
 
 		 110 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  69.9 
 
 		 105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  63.64 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.55 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.55 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  60.91 
 
 		 110 aa  140  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  61.82 
 
 		 111 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  62.5 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.96 
 
 		 110 aa  121  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.21 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  57.14 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  52.83 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  54.29 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  58.7 
 
 		 107 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  52.78 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  51 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  56 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  50 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  45.28 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.08 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  48.98 
 
 		 109 aa  104  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  40.74 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.45 
 
 		 111 aa  95.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.92 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.56 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.56 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.89 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  49.44 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  45.83 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  50.6 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.45 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.68 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.42 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  40.82 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.42 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  38.14 
 
 		 219 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  38.38 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.11 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  38.37 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.46 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  34.83 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  35.05 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  33.67 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  29.25 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  38.46 
 
 		 312 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  39.47 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  30 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  37.68 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  28.09 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  31.43 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  29.82 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  27.5 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  28.81 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  30.43 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  35.56 
 
 		 357 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.68 
 
 		 111 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>