40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1022 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
111 aa  228  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  82.41 
 
 
113 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  60.19 
 
 
110 aa  143  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  60.19 
 
 
109 aa  137  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  59.09 
 
 
110 aa  134  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.26 
 
 
112 aa  133  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  59.09 
 
 
110 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.73 
 
 
114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  53.7 
 
 
111 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  53.15 
 
 
130 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  54.13 
 
 
112 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 
277 aa  120  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.85 
 
 
132 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  52.83 
 
 
114 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  52.83 
 
 
114 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  52.83 
 
 
114 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  46.36 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  47.17 
 
 
110 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  48.11 
 
 
110 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  48.15 
 
 
111 aa  94  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  40.19 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  37.5 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  39.81 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  41.94 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  41.58 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  40.48 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  37.89 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  35.71 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  39.44 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  30.23 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 
111 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  31.19 
 
 
115 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  30.14 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 
111 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.68 
 
 
110 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>