31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1759 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  216  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  59.81 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  61.36 
 
 
110 aa  104  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  62.64 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  48.11 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  49.02 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  45.26 
 
 
111 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  47.17 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.04 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.12 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  43.69 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  44.34 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  44.23 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  42.31 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  44.34 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  45.54 
 
 
277 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  44.34 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  45.54 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  41.75 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  41.75 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.58 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  38.61 
 
 
110 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  45.54 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.05 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  38.39 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  38.1 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  39.13 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  38.71 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  39.71 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>