37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4297 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  214  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  66.36 
 
 
110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  59.63 
 
 
110 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  55.45 
 
 
114 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  55.45 
 
 
114 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  55.45 
 
 
114 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  50.91 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.72 
 
 
112 aa  110  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  55.66 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  55.88 
 
 
277 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  54.21 
 
 
111 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  55.66 
 
 
110 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  55.66 
 
 
110 aa  103  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.01 
 
 
114 aa  103  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  49.53 
 
 
130 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  47.27 
 
 
110 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.11 
 
 
111 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.89 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  51.4 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  47.66 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  47.56 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  47.17 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  41.76 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  40.78 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  40.37 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  40.91 
 
 
110 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  45.45 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  41.67 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  36.79 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  36.11 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  38.6 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  36.36 
 
 
111 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  34.33 
 
 
111 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  26.87 
 
 
219 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0991  hypothetical protein  31.43 
 
 
117 aa  40  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.166279  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  30.99 
 
 
110 aa  40  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>