35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3698 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  216  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  56.48 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  55.66 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  53.21 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  53.7 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  52.78 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.64 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.7 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  51.85 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  52.34 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  50.93 
 
 		 277 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  48.15 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.15 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  51.4 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  45.87 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  48.15 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  48.15 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  49.54 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  48.15 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.13 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  47.17 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  46.67 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  51.85 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  41.75 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  39.81 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  36.17 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1039  hypothetical protein  27.14 
 
 		 110 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.67228  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  32.93 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.3 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  40.3 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  40.58 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  35.06 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>