49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3536 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 114 aa  224  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  70 
 
 		 277 aa  150  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  69.81 
 
 		 109 aa  149  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  65.45 
 
 		 110 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.75 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  66.06 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  63.3 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  66.06 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  66.06 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  64.15 
 
 		 110 aa  141  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.73 
 
 		 111 aa  138  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  61.82 
 
 		 110 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  56.76 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  59.43 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.49 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  54.21 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  61.95 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  57.01 
 
 		 110 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  51.82 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  54.21 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  54.13 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  45.37 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  43.52 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  43.27 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  36.45 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  41.9 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  38.46 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  46.15 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1814  hypothetical protein  38.55 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  37.68 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  42.25 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  39.44 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  36.23 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  29.79 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  37.7 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  33.82 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.55 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  36.76 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  44.07 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  30.43 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1039  hypothetical protein  30.38 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.67228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>