45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2089 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  67.92 
 
 		 109 aa  148  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.27 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  58.49 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  57.55 
 
 		 110 aa  130  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  58.88 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.3 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.15 
 
 		 111 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  54.46 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  54.46 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  55.66 
 
 		 277 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  54.46 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  51.89 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  52.34 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  49.53 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.43 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  54.72 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  47.66 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  49.06 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  49.53 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  40.5 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  45.87 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  44.76 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  43.01 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  41.75 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  37.23 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  37.33 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  36.05 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1039  hypothetical protein  35 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.67228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  33.78 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  34.92 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  34.29 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  30.88 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1814  hypothetical protein  32.89 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  34.52 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  30.43 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  28.41 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  30.43 
 
 		 107 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>