73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0351 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  226  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.26 
 
 		 111 aa  153  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  56.36 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  60 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  56.36 
 
 		 111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  57.55 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.27 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  61.7 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  52.73 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  58.1 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  56.76 
 
 		 114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  57.55 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  52.38 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  60 
 
 		 105 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.83 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.15 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.15 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  49.53 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.09 
 
 		 110 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  53.19 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  57.61 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  48.48 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 111 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.94 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.09 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.23 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.24 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.78 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.19 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.19 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  43.01 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  42.7 
 
 		 219 aa  86.3  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  40.45 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  40.4 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  43.37 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  37.63 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  34.51 
 
 		 219 aa  67.4  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  36.78 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.77 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.11 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  26.04 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  35.59 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  36.23 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  29.35 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  38 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  26.14 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  32.35 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  25.33 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  32.35 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  34.85 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  27.03 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 277 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  25.33 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  30.43 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  28.09 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  34.78 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  35.42 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  34.57 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>