67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0280 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 363 aa  744    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  78.74 
 
 		 377 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  76.29 
 
 		 372 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  76.88 
 
 		 367 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  77.17 
 
 		 365 aa  539  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  71.97 
 
 		 357 aa  531  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.19 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.13 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.87 
 
 		 370 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  34.78 
 
 		 348 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 		 374 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  34.09 
 
 		 364 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  35.1 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  34.81 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  34.22 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  34.22 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  34.22 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  34.35 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  33.24 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  34.1 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  34.2 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  32.74 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  34.1 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  35.61 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  32.74 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  34.2 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  34.86 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  33.62 
 
 		 348 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  32.08 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  32.08 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  31.79 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  31.79 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  31.79 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  31.79 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  31.79 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  33.05 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  34.29 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  33.71 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  34.9 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  33.82 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  31.86 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  32.46 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 368 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  32.39 
 
 		 331 aa  157  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  32.56 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  31.96 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  33.12 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  33.12 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  34.37 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  32.95 
 
 		 324 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  29.68 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  31.2 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  33.91 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  29.66 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  29.7 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  28.66 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  33.06 
 
 		 134 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  31.97 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  30.1 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>