81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4624 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  703    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  49.71 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  50.15 
 
 		 347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  50.15 
 
 		 348 aa  328  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  47.93 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  49.25 
 
 		 348 aa  322  6e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  49.27 
 
 		 353 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  49.25 
 
 		 347 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  49.25 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  49.25 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  48.98 
 
 		 353 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  48.96 
 
 		 370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  49.12 
 
 		 348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  49.41 
 
 		 348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  49.41 
 
 		 348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  47.66 
 
 		 362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  46.13 
 
 		 345 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  48.2 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  45.78 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  47.6 
 
 		 342 aa  305  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  47.31 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  47.31 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  47.31 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  47.31 
 
 		 345 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  47.31 
 
 		 345 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  46.27 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  47.06 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  43.5 
 
 		 348 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.92 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.8 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.87 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  35.4 
 
 		 379 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  34.81 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  33.24 
 
 		 370 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  35.52 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  35.31 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  35.73 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  34.23 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.9 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  32.24 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  34.68 
 
 		 377 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  33.24 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  32.65 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  34.21 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  31.94 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  34.71 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  33.63 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  36.14 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  34.71 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.64 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  33.72 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  31.95 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  29.82 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  29.45 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  32.3 
 
 		 361 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  32.3 
 
 		 361 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  32.3 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  32.3 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  32.3 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  29.43 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  31.15 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  25.17 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 134 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03600  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  23.05 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  25.61 
 
 		 358 aa  46.2  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  30.67 
 
 		 148 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  39.44 
 
 		 159 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  27.08 
 
 		 178 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2077  hypothetical protein  25.83 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.520614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0568  cupin 2 domain-containing protein  27.38 
 
 		 148 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  25.55 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  24.63 
 
 		 181 aa  43.5  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  27.38 
 
 		 162 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  35.44 
 
 		 149 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  27.46 
 
 		 366 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>