85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1994 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  66.67 
 
 		 178 aa  246  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  30.06 
 
 		 387 aa  82  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  34.4 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.86 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  35.77 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39 
 
 		 370 aa  71.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  36.45 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 361 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 361 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  34.29 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 361 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 361 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  29.41 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  35.64 
 
 		 318 aa  61.2  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  27.14 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  31.96 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  27.14 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  26.95 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  34.57 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  36.9 
 
 		 379 aa  58.2  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  31.96 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  31.71 
 
 		 376 aa  58.2  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  25.36 
 
 		 348 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  25.71 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  27.7 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  31.36 
 
 		 353 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 		 347 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  34.18 
 
 		 348 aa  54.7  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  24.48 
 
 		 357 aa  54.7  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  27.48 
 
 		 343 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  23.78 
 
 		 349 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 349 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 362 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  26.28 
 
 		 351 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  33.91 
 
 		 324 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  26.45 
 
 		 365 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  34.15 
 
 		 331 aa  52.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  26.74 
 
 		 358 aa  52.4  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  36.05 
 
 		 129 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  28.87 
 
 		 345 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  28.87 
 
 		 345 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  28.87 
 
 		 345 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  28.87 
 
 		 345 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  28.87 
 
 		 345 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  25.83 
 
 		 364 aa  52  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  26.96 
 
 		 370 aa  51.6  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  28.92 
 
 		 159 aa  50.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  25.56 
 
 		 345 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  27.03 
 
 		 367 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  25.74 
 
 		 351 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  32.05 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  30.83 
 
 		 348 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  24.35 
 
 		 364 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  30.43 
 
 		 372 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  28.66 
 
 		 353 aa  48.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  26.27 
 
 		 348 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  26.27 
 
 		 348 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  29.49 
 
 		 366 aa  47.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10191  predicted protein  30.93 
 
 		 295 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538025  normal  0.129963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  30.49 
 
 		 334 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  31.3 
 
 		 377 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  27.45 
 
 		 345 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  30.43 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  31.67 
 
 		 348 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  27.27 
 
 		 368 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  28.7 
 
 		 356 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 131 aa  44.7  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 158 aa  44.7  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1927  hypothetical protein  27.5 
 
 		 148 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0136451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  24.63 
 
 		 344 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2077  hypothetical protein  26.97 
 
 		 309 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.520614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 351 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  30.88 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 123 aa  42.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 123 aa  42.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3086  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  23.73 
 
 		 366 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.407832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 131 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  30.88 
 
 		 662 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>