76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2627 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  100 
 
 		 348 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  100 
 
 		 348 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  72.7 
 
 		 348 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  72.33 
 
 		 348 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  73.24 
 
 		 347 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  73.24 
 
 		 347 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  72.35 
 
 		 347 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  72.35 
 
 		 347 aa  524  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  73.78 
 
 		 348 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  72.67 
 
 		 370 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  69.45 
 
 		 364 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  61.63 
 
 		 345 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  61.63 
 
 		 345 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  61.63 
 
 		 345 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  61.63 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  60.64 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  61.63 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  62.91 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  60.64 
 
 		 342 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  60.29 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  60.17 
 
 		 364 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  60.17 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  59.94 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  55.43 
 
 		 345 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  55.59 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  55 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  47.32 
 
 		 353 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  49.41 
 
 		 344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.07 
 
 		 350 aa  288  8e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  41.91 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.47 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  40.29 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.06 
 
 		 370 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  40 
 
 		 376 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  37.18 
 
 		 379 aa  245  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.53 
 
 		 377 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  38.08 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.65 
 
 		 374 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  37.69 
 
 		 370 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  36.81 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  39.94 
 
 		 361 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  39.94 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  39.3 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  39.3 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  39.3 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  36.26 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  34.39 
 
 		 372 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  34.72 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  36.45 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  33.24 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  34.1 
 
 		 367 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  33.53 
 
 		 343 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  34.72 
 
 		 345 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  33.43 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  36.22 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  34.55 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  33.13 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  33.04 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  40.42 
 
 		 255 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  36.55 
 
 		 283 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  30.54 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  31.46 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  34.34 
 
 		 134 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 162 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 162 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 162 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  31.25 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  26.27 
 
 		 181 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 162 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0568  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 148 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  26.77 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  32 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  28.74 
 
 		 178 aa  43.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>