78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2125 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 
364 aa  755    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  64.86 
 
 
370 aa  454  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  63.14 
 
 
364 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  63.58 
 
 
348 aa  434  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  60.17 
 
 
348 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  62.9 
 
 
362 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  60.17 
 
 
348 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  62.1 
 
 
348 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  62.29 
 
 
353 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  60.12 
 
 
347 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  59.54 
 
 
347 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  59.89 
 
 
348 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  60.12 
 
 
347 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  60.4 
 
 
347 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  60.29 
 
 
348 aa  418  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  62 
 
 
353 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  56.77 
 
 
342 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  56.48 
 
 
342 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  56.4 
 
 
345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  56.4 
 
 
345 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  56.4 
 
 
345 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  56.4 
 
 
345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  56.4 
 
 
345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  58.72 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  57.02 
 
 
349 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  53.49 
 
 
345 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  47.23 
 
 
353 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  47.06 
 
 
344 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.18 
 
 
350 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.17 
 
 
364 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.54 
 
 
370 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  38.84 
 
 
387 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  39.12 
 
 
379 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  37.18 
 
 
370 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  38.61 
 
 
376 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.57 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  37.67 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  36.21 
 
 
379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.19 
 
 
377 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  34.73 
 
 
377 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  36.52 
 
 
334 aa  203  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  35.34 
 
 
357 aa  202  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  35.47 
 
 
368 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  36.44 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  34.31 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  35.38 
 
 
372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  36.08 
 
 
367 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  33.91 
 
 
343 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 
365 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  33.24 
 
 
351 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  33.53 
 
 
351 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.2 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  34.76 
 
 
361 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  33.06 
 
 
330 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 
361 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  32.86 
 
 
356 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  34.45 
 
 
361 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  31.44 
 
 
331 aa  175  9e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 
361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  35.87 
 
 
370 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  36.21 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  34.69 
 
 
255 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  29.59 
 
 
324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  25 
 
 
178 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  34.31 
 
 
134 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  27.67 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  25.83 
 
 
181 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  33.91 
 
 
366 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 
162 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 
162 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 
162 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  34.18 
 
 
148 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 
162 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0568  cupin 2 domain-containing protein  34.92 
 
 
148 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  26.25 
 
 
358 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  33.82 
 
 
159 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  28.28 
 
 
356 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>