73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0819 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 376 aa  782    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  75.68 
 
 		 373 aa  594  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  69.17 
 
 		 379 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  67.11 
 
 		 387 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  69.78 
 
 		 368 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.31 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  56.56 
 
 		 379 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.51 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.07 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.53 
 
 		 364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.23 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  41.3 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  43.07 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  40 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  40 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  38.94 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  41.67 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  39.64 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  41.07 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  36.41 
 
 		 370 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  39.88 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  39.31 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  39.04 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  39.88 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  39.58 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  39.29 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  39.35 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  39.29 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  38.99 
 
 		 347 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  37.93 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  37.93 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  37.93 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  38.53 
 
 		 362 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  37.93 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  37.93 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  39.47 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  38.61 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  37.54 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  35.37 
 
 		 353 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  37.6 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  37.88 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  37.88 
 
 		 356 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  37.33 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  37.33 
 
 		 361 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  38.78 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  36.69 
 
 		 372 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  36.57 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  36.77 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.61 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  36.8 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  32.65 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  32.73 
 
 		 330 aa  176  8e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  33.81 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  33.24 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  36.75 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  32.03 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  33.53 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  32.41 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  41.6 
 
 		 255 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  30.97 
 
 		 349 aa  157  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  29.43 
 
 		 324 aa  123  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  31.58 
 
 		 178 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1927  hypothetical protein  27.96 
 
 		 148 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0136451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  27.68 
 
 		 134 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  23.08 
 
 		 159 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  24.47 
 
 		 148 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  24.47 
 
 		 162 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  24.47 
 
 		 162 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  24.47 
 
 		 162 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>